La Pinacoteca conserva un'importante collezione iconografica che illustra le trasformazioni del tessuto urbano e le principali manifestazioni della vita pubblica e privata della città di Milano tra il XVII e il XIX secolo, con un nucleo di dipinti e sculture  che documentano la storia della città dalla dominazione spagnola agli inizi del Novecento.

Le sale monumentali invece, custodiscono i dipinti e parte degli arredi della collezione Morando, una serie di esemplari di arte applicata (maioliche, bronzi): un percorso suggestivo che documenta in modo esemplare il gusto settecentesco per l'arredo domestico, attraverso un nucleo di decorazioni, mobili e oggettistica recentemente ricomposto nella sua fisionomia originaria con una capillare attività di recupero di un patrimonio nel tempo disperso.